由于永乐大典数量众多，参与者众多，前后体例不同，前后错误不可避免，但这并不影响其巨大价值。永乐大典最大的贡献就是保存了明初以前中国各学科的大量文献资料。在这方面，清朝的一些学者在《永乐大典》中失去了作品。乾隆年间，安徽学政朱筠在开设《四库全书》馆时，邀请“学校永乐大典”，选择其中人不常见的书籍”，获得清高宗批准。乾隆三十八年(1773)，成立了《四库全书》馆“校勘永乐大典散文办事处”，其中包括著名学者戴震、邵晋涵、周永年。到乾隆46年(1781)，共出版书籍:经部66种，历史部41种，子部103种，集部175种，共385种，4946卷。西晋杜预的《春秋释例》等重要文献、唐林宝的《元和姓》、北宋薛居正的《旧五代史》、南宋李心传的《建炎以来系年要录》;宋代医学名为“苏沈良方”、《博济方》、《伤寒微旨》等都是丢失已久的秘籍，全靠《永乐大典》才能保存下来。
今天，中国古代广阔的文化经典只流传了1%和2%，其他人最终因为自然或人为的破坏而在漫长的历史河流中消失了。古代经典是承载古代文明和文化的“郑和宝船”。它的形式、语言和内容是一个时代历史的真实写照，可以激发人们探索宝藏的强烈冲动。
《永乐大典》就是这样一艘“宝船”，曾经如此庞大华丽，把中国14世纪以前的所有文化都放进了它的仓库。元朝道教经历了毁灭性的打击，元朝的统治者几乎烧毁了所有关于道教的书籍。在明代，流传于世的道教经典不到宋元时期的三分之一。《永乐大典》最大限度地记录了明朝以前所有的道教经典。但现在，人们只能通过露在水面上的一小段桅杆来猜测沉没宝船的一切。历史上的永乐仪式给人们带来了太多的惊喜和赞扬，它的毁灭也带来了同样强烈的悲伤和遗憾，留下了许多谜题需要探索。当代很多人不知道《永乐大典》是什么书，很多熟悉《永乐大典》的人一辈子都看不到《永乐大典》的原貌。
《永乐大典》所载的书以宋元时期为主，到明代编辑《文渊阁书目》时，这些书已经十不存三四了。到了清代，只有十分之一和二还在流传。此外，《永乐大典》除了正规的儒家典籍、历史传记百家、历代文集等外，还包含了大量的方舆志成、小说戏曲、医学方技、道佛典籍等。因此，历代学者都把《永乐大典》视为编辑的起源。他们爬上去梳理，总结了分散在各卷中的经典，使许多丢失的书籍重现了这个世界。
清代学者记录了宋元文人的诗集和宋元的历史资料。近代以来，歌剧、地方志、科技书籍和医学作品开始受到人们的重视和记录。仪式上的佛教和道教材料也逐渐被人们所认识。让我们来看看历代编辑丢失的过程和结果。